Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

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Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms