Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCOF1Q13428 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCOF1Q13428 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCOF1Q13428 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCOF1Q13428 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCOF1Q13428 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCOF1Q13428 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCOF1Q13428 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCOF1Q13428 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCOF1Q13428 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCOF1Q13428 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCOF1Q13428 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCOF1Q13428 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCOF1Q13428 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCOF1Q13428 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCOF1Q13428 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCOF1Q13428 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCOF1Q13428 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCOF1Q13428 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TCOF1Q13428 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCOF1Q13428 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCOF1Q13428 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TCOF1Q13428 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCOF1Q13428 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCOF1Q13428 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCOF1Q13428 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TCOF1Q13428 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCOF1Q13428 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCOF1Q13428 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCOF1Q13428 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCOF1Q13428 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCOF1Q13428 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCOF1Q13428 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCOF1Q13428 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCOF1Q13428 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCOF1Q13428 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TCOF1Q13428 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TCOF1Q13428 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TCOF1Q13428 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TCOF1Q13428 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TCOF1Q13428 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TCOF1Q13428 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
TCOF1Q13428 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TCOF1Q13428 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TCOF1Q13428 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TCOF1Q13428 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
TCOF1Q13428 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TCOF1Q13428 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TCOF1Q13428 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TCOF1Q13428 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TCOF1Q13428 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TCOF1Q13428 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCOF1Q13428 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCOF1Q13428 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCOF1Q13428 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCOF1Q13428 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TCOF1Q13428 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TCOF1Q13428 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TCOF1Q13428 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCOF1Q13428 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCOF1Q13428 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCOF1Q13428 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TCOF1Q13428 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCOF1Q13428 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCOF1Q13428 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCOF1Q13428 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCOF1Q13428 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCOF1Q13428 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCOF1Q13428 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCOF1Q13428 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCOF1Q13428 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCOF1Q13428 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCOF1Q13428 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCOF1Q13428 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCOF1Q13428 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCOF1Q13428 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCOF1Q13428 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCOF1Q13428 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCOF1Q13428 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCOF1Q13428 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCOF1Q13428 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCOF1Q13428 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCOF1Q13428 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCOF1Q13428 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCOF1Q13428 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCOF1Q13428 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCOF1Q13428 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCOF1Q13428 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCOF1Q13428 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TCOF1Q13428 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCOF1Q13428 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCOF1Q13428 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCOF1Q13428 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCOF1Q13428 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCOF1Q13428 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCOF1Q13428 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCOF1Q13428 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCOF1Q13428 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCOF1Q13428 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCOF1Q13428 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
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