Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRHP20396 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TRHP20396 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRHP20396 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRHP20396 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRHP20396 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRHP20396 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRHP20396 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TRHP20396 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRHP20396 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TRHP20396 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TRHP20396 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TRHP20396 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRHP20396 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRHP20396 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRHP20396 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRHP20396 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TRHP20396 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TRHP20396 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRHP20396 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TRHP20396 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRHP20396 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRHP20396 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
TRHP20396 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRHP20396 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRHP20396 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRHP20396 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRHP20396 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRHP20396 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRHP20396 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRHP20396 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRHP20396 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRHP20396 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TRHP20396 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRHP20396 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRHP20396 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TRHP20396 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRHP20396 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TRHP20396 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TRHP20396 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TRHP20396 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TRHP20396 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRHP20396 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRHP20396 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRHP20396 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRHP20396 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRHP20396 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRHP20396 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TRHP20396 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TRHP20396 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRHP20396 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRHP20396 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRHP20396 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRHP20396 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRHP20396 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRHP20396 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRHP20396 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRHP20396 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRHP20396 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRHP20396 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRHP20396 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRHP20396 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TRHP20396 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRHP20396 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRHP20396 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRHP20396 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRHP20396 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRHP20396 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TRHP20396 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRHP20396 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRHP20396 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TRHP20396 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TRHP20396 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRHP20396 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TRHP20396 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRHP20396 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRHP20396 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRHP20396 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TRHP20396 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRHP20396 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRHP20396 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRHP20396 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRHP20396 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRHP20396 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRHP20396 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRHP20396 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRHP20396 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRHP20396 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRHP20396 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRHP20396 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRHP20396 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRHP20396 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRHP20396 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRHP20396 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRHP20396 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRHP20396 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRHP20396 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRHP20396 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRHP20396 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRHP20396 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms