Protein–RNA interactions for Protein: P0C1Z6

TFPT, TCF3 fusion partner, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFPTP0C1Z6 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms