Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
C4BP0C0L5 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms