Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F6O75461 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F6O75461 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F6O75461 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F6O75461 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F6O75461 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F6O75461 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F6O75461 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F6O75461 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F6O75461 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F6O75461 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F6O75461 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F6O75461 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F6O75461 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F6O75461 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F6O75461 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F6O75461 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F6O75461 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F6O75461 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F6O75461 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F6O75461 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F6O75461 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F6O75461 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F6O75461 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F6O75461 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F6O75461 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F6O75461 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F6O75461 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F6O75461 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F6O75461 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F6O75461 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F6O75461 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F6O75461 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F6O75461 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F6O75461 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F6O75461 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F6O75461 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F6O75461 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F6O75461 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F6O75461 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F6O75461 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F6O75461 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F6O75461 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F6O75461 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F6O75461 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F6O75461 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F6O75461 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F6O75461 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F6O75461 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F6O75461 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F6O75461 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F6O75461 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F6O75461 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F6O75461 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F6O75461 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F6O75461 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
E2F6O75461 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
E2F6O75461 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
E2F6O75461 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
E2F6O75461 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F6O75461 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F6O75461 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F6O75461 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F6O75461 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F6O75461 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F6O75461 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F6O75461 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F6O75461 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F6O75461 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F6O75461 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F6O75461 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F6O75461 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F6O75461 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F6O75461 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F6O75461 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F6O75461 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F6O75461 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F6O75461 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F6O75461 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F6O75461 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F6O75461 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F6O75461 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F6O75461 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F6O75461 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F6O75461 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F6O75461 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F6O75461 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F6O75461 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F6O75461 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F6O75461 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F6O75461 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F6O75461 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F6O75461 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F6O75461 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F6O75461 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F6O75461 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F6O75461 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F6O75461 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F6O75461 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F6O75461 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms