Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EDIL3O43854 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EDIL3O43854 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EDIL3O43854 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EDIL3O43854 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EDIL3O43854 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EDIL3O43854 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EDIL3O43854 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EDIL3O43854 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EDIL3O43854 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EDIL3O43854 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EDIL3O43854 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EDIL3O43854 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EDIL3O43854 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EDIL3O43854 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EDIL3O43854 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EDIL3O43854 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EDIL3O43854 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EDIL3O43854 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms