Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y210

TRPC6, Short transient receptor potential channel 6, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC6Q9Y210 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 IL20RB-AS1-201ENST00000462176 562 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 LRRIQ3-203ENST00000370911 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 METTL15-210ENST00000634721 1182 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC6Q9Y210 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRPC6Q9Y210 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRPC6Q9Y210 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRPC6Q9Y210 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRPC6Q9Y210 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRPC6Q9Y210 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRPC6Q9Y210 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRPC6Q9Y210 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRPC6Q9Y210 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRPC6Q9Y210 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
TRPC6Q9Y210 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC6Q9Y210 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC6Q9Y210 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC6Q9Y210 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC6Q9Y210 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC6Q9Y210 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC6Q9Y210 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC6Q9Y210 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC6Q9Y210 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC6Q9Y210 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC6Q9Y210 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC6Q9Y210 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC6Q9Y210 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC6Q9Y210 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC6Q9Y210 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC6Q9Y210 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC6Q9Y210 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC6Q9Y210 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC6Q9Y210 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC6Q9Y210 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC6Q9Y210 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms