Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL13Q9P2N7 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms