Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRRTQ9BXP5 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms