Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3R4Q99570 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms