Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBW4

SLC38A9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A9Q8NBW4 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.6 ms