Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM72Q6ZMU5 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRIM72Q6ZMU5 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRIM72Q6ZMU5 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRIM72Q6ZMU5 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRIM72Q6ZMU5 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRIM72Q6ZMU5 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRIM72Q6ZMU5 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRIM72Q6ZMU5 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM72Q6ZMU5 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM72Q6ZMU5 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM72Q6ZMU5 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM72Q6ZMU5 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM72Q6ZMU5 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM72Q6ZMU5 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM72Q6ZMU5 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM72Q6ZMU5 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM72Q6ZMU5 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM72Q6ZMU5 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM72Q6ZMU5 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM72Q6ZMU5 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM72Q6ZMU5 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM72Q6ZMU5 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM72Q6ZMU5 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM72Q6ZMU5 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM72Q6ZMU5 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM72Q6ZMU5 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM72Q6ZMU5 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM72Q6ZMU5 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM72Q6ZMU5 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM72Q6ZMU5 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM72Q6ZMU5 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM72Q6ZMU5 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM72Q6ZMU5 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM72Q6ZMU5 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM72Q6ZMU5 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM72Q6ZMU5 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM72Q6ZMU5 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM72Q6ZMU5 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM72Q6ZMU5 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM72Q6ZMU5 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM72Q6ZMU5 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM72Q6ZMU5 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM72Q6ZMU5 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM72Q6ZMU5 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM72Q6ZMU5 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM72Q6ZMU5 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM72Q6ZMU5 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM72Q6ZMU5 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM72Q6ZMU5 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM72Q6ZMU5 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM72Q6ZMU5 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM72Q6ZMU5 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM72Q6ZMU5 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM72Q6ZMU5 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms