Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms