Protein–RNA interactions for Protein: Q08AD1

CAMSAP2, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP2Q08AD1 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAMSAP2Q08AD1 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAMSAP2Q08AD1 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAMSAP2Q08AD1 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAMSAP2Q08AD1 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAMSAP2Q08AD1 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAMSAP2Q08AD1 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAMSAP2Q08AD1 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAMSAP2Q08AD1 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAMSAP2Q08AD1 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAMSAP2Q08AD1 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAMSAP2Q08AD1 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CAMSAP2Q08AD1 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAMSAP2Q08AD1 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAMSAP2Q08AD1 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAMSAP2Q08AD1 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAMSAP2Q08AD1 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAMSAP2Q08AD1 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CAMSAP2Q08AD1 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CAMSAP2Q08AD1 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAMSAP2Q08AD1 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAMSAP2Q08AD1 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAMSAP2Q08AD1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAMSAP2Q08AD1 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAMSAP2Q08AD1 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAMSAP2Q08AD1 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAMSAP2Q08AD1 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAMSAP2Q08AD1 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAMSAP2Q08AD1 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAMSAP2Q08AD1 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAMSAP2Q08AD1 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAMSAP2Q08AD1 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAMSAP2Q08AD1 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAMSAP2Q08AD1 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAMSAP2Q08AD1 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CAMSAP2Q08AD1 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CAMSAP2Q08AD1 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CAMSAP2Q08AD1 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAMSAP2Q08AD1 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAMSAP2Q08AD1 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAMSAP2Q08AD1 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAMSAP2Q08AD1 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAMSAP2Q08AD1 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAMSAP2Q08AD1 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAMSAP2Q08AD1 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAMSAP2Q08AD1 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAMSAP2Q08AD1 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAMSAP2Q08AD1 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAMSAP2Q08AD1 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAMSAP2Q08AD1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAMSAP2Q08AD1 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAMSAP2Q08AD1 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAMSAP2Q08AD1 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAMSAP2Q08AD1 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAMSAP2Q08AD1 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAMSAP2Q08AD1 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CAMSAP2Q08AD1 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAMSAP2Q08AD1 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAMSAP2Q08AD1 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAMSAP2Q08AD1 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAMSAP2Q08AD1 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAMSAP2Q08AD1 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAMSAP2Q08AD1 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAMSAP2Q08AD1 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAMSAP2Q08AD1 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAMSAP2Q08AD1 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAMSAP2Q08AD1 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAMSAP2Q08AD1 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAMSAP2Q08AD1 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAMSAP2Q08AD1 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAMSAP2Q08AD1 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAMSAP2Q08AD1 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAMSAP2Q08AD1 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAMSAP2Q08AD1 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAMSAP2Q08AD1 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CAMSAP2Q08AD1 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAMSAP2Q08AD1 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAMSAP2Q08AD1 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAMSAP2Q08AD1 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAMSAP2Q08AD1 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CAMSAP2Q08AD1 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CAMSAP2Q08AD1 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAMSAP2Q08AD1 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAMSAP2Q08AD1 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAMSAP2Q08AD1 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAMSAP2Q08AD1 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAMSAP2Q08AD1 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAMSAP2Q08AD1 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CAMSAP2Q08AD1 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAMSAP2Q08AD1 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CAMSAP2Q08AD1 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAMSAP2Q08AD1 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CAMSAP2Q08AD1 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAMSAP2Q08AD1 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAMSAP2Q08AD1 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CAMSAP2Q08AD1 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAMSAP2Q08AD1 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAMSAP2Q08AD1 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAMSAP2Q08AD1 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CAMSAP2Q08AD1 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms