Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms