Protein–RNA interactions for Protein: P58304

VSX2, Visual system homeobox 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX2P58304 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VSX2P58304 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSX2P58304 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSX2P58304 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSX2P58304 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSX2P58304 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSX2P58304 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSX2P58304 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSX2P58304 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VSX2P58304 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSX2P58304 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSX2P58304 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSX2P58304 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSX2P58304 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSX2P58304 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSX2P58304 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VSX2P58304 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VSX2P58304 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSX2P58304 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSX2P58304 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSX2P58304 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSX2P58304 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSX2P58304 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSX2P58304 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VSX2P58304 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VSX2P58304 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSX2P58304 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSX2P58304 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSX2P58304 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSX2P58304 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSX2P58304 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSX2P58304 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSX2P58304 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSX2P58304 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSX2P58304 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSX2P58304 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSX2P58304 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSX2P58304 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VSX2P58304 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSX2P58304 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSX2P58304 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSX2P58304 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSX2P58304 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSX2P58304 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VSX2P58304 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSX2P58304 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSX2P58304 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSX2P58304 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSX2P58304 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSX2P58304 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSX2P58304 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VSX2P58304 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSX2P58304 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSX2P58304 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSX2P58304 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSX2P58304 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSX2P58304 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSX2P58304 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSX2P58304 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSX2P58304 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSX2P58304 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSX2P58304 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSX2P58304 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSX2P58304 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSX2P58304 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSX2P58304 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSX2P58304 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSX2P58304 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VSX2P58304 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSX2P58304 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSX2P58304 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSX2P58304 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSX2P58304 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSX2P58304 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSX2P58304 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSX2P58304 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VSX2P58304 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSX2P58304 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSX2P58304 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSX2P58304 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSX2P58304 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSX2P58304 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSX2P58304 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSX2P58304 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSX2P58304 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSX2P58304 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSX2P58304 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSX2P58304 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSX2P58304 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSX2P58304 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSX2P58304 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSX2P58304 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSX2P58304 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSX2P58304 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSX2P58304 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSX2P58304 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSX2P58304 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSX2P58304 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSX2P58304 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSX2P58304 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91 ms