Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18530 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18530 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18530 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18530 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
P18530 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18530 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18530 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18530 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18530 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18530 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18530 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18530 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18530 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18530 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18530 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18530 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18530 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18530 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18530 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18530 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18530 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18530 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18530 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18530 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18530 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18530 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18530 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18530 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18530 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18530 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18530 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18530 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18530 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18530 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18530 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
P18530 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18530 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18530 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18530 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18530 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18530 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18530 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18530 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18530 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18530 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18530 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18530 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18530 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18530 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18530 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
P18530 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18530 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18530 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18530 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18530 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18530 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18530 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18530 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18530 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18530 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18530 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18530 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18530 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18530 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18530 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18530 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18530 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18530 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18530 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18530 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18530 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18530 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18530 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18530 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18530 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18530 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18530 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
P18530 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18530 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
P18530 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18530 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
P18530 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18530 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18530 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18530 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18530 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18530 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18530 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18530 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18530 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18530 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18530 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18530 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18530 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18530 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18530 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18530 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
P18530 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
P18530 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms