Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms