Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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PKHD1P08F94 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
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