Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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SEC22CQ9BRL7 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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SEC22CQ9BRL7 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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SEC22CQ9BRL7 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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SEC22CQ9BRL7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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SEC22CQ9BRL7 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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SEC22CQ9BRL7 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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