Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEDD1Q8NHV4 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEDD1Q8NHV4 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NEDD1Q8NHV4 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NEDD1Q8NHV4 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NEDD1Q8NHV4 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NEDD1Q8NHV4 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NEDD1Q8NHV4 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NEDD1Q8NHV4 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms