Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms