Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms