Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM29Q14134 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM29Q14134 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM29Q14134 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms