Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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