Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms