Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms