Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2A2P52657 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms