Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DBF4Q9UBU7 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms