Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms