Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms