Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms