Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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RTL8BQ17RB0 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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RTL8BQ17RB0 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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RTL8BQ17RB0 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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RTL8BQ17RB0 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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RTL8BQ17RB0 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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