Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NFIXQ14938 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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