Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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CALCOCO2Q13137 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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CALCOCO2Q13137 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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CALCOCO2Q13137 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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CALCOCO2Q13137 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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