Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
AP1B1Q10567 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms