Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CGNL1Q0VF96 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms