Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms