Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms