Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms