Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DMDP11532 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DMDP11532 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DMDP11532 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DMDP11532 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DMDP11532 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DMDP11532 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DMDP11532 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DMDP11532 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DMDP11532 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DMDP11532 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DMDP11532 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DMDP11532 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DMDP11532 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DMDP11532 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DMDP11532 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DMDP11532 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DMDP11532 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DMDP11532 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DMDP11532 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DMDP11532 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DMDP11532 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DMDP11532 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DMDP11532 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DMDP11532 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DMDP11532 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DMDP11532 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DMDP11532 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DMDP11532 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DMDP11532 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DMDP11532 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DMDP11532 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DMDP11532 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DMDP11532 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DMDP11532 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DMDP11532 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DMDP11532 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DMDP11532 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DMDP11532 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DMDP11532 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DMDP11532 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DMDP11532 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DMDP11532 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DMDP11532 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DMDP11532 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DMDP11532 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DMDP11532 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DMDP11532 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DMDP11532 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DMDP11532 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DMDP11532 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DMDP11532 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DMDP11532 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DMDP11532 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DMDP11532 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DMDP11532 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DMDP11532 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DMDP11532 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DMDP11532 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DMDP11532 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DMDP11532 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DMDP11532 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DMDP11532 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DMDP11532 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
DMDP11532 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DMDP11532 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DMDP11532 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DMDP11532 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DMDP11532 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DMDP11532 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DMDP11532 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DMDP11532 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DMDP11532 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DMDP11532 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DMDP11532 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DMDP11532 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
DMDP11532 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DMDP11532 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DMDP11532 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DMDP11532 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DMDP11532 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
DMDP11532 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DMDP11532 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DMDP11532 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DMDP11532 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DMDP11532 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DMDP11532 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DMDP11532 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DMDP11532 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DMDP11532 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DMDP11532 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DMDP11532 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DMDP11532 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DMDP11532 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DMDP11532 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DMDP11532 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DMDP11532 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DMDP11532 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DMDP11532 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DMDP11532 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms