Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DENRO43583 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DENRO43583 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DENRO43583 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DENRO43583 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DENRO43583 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DENRO43583 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
DENRO43583 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DENRO43583 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DENRO43583 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DENRO43583 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DENRO43583 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DENRO43583 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DENRO43583 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DENRO43583 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DENRO43583 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DENRO43583 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DENRO43583 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DENRO43583 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DENRO43583 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DENRO43583 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DENRO43583 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DENRO43583 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DENRO43583 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DENRO43583 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DENRO43583 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DENRO43583 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
DENRO43583 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DENRO43583 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
DENRO43583 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DENRO43583 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DENRO43583 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
DENRO43583 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
DENRO43583 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DENRO43583 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DENRO43583 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DENRO43583 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DENRO43583 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
DENRO43583 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
DENRO43583 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
DENRO43583 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DENRO43583 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DENRO43583 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DENRO43583 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DENRO43583 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DENRO43583 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DENRO43583 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DENRO43583 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DENRO43583 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DENRO43583 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
DENRO43583 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DENRO43583 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DENRO43583 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DENRO43583 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DENRO43583 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DENRO43583 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DENRO43583 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DENRO43583 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DENRO43583 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DENRO43583 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DENRO43583 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DENRO43583 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DENRO43583 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DENRO43583 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DENRO43583 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DENRO43583 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DENRO43583 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DENRO43583 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DENRO43583 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DENRO43583 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DENRO43583 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DENRO43583 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DENRO43583 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DENRO43583 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DENRO43583 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DENRO43583 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DENRO43583 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DENRO43583 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DENRO43583 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DENRO43583 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DENRO43583 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DENRO43583 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DENRO43583 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DENRO43583 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DENRO43583 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DENRO43583 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DENRO43583 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
DENRO43583 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DENRO43583 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DENRO43583 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DENRO43583 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DENRO43583 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DENRO43583 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
DENRO43583 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DENRO43583 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DENRO43583 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DENRO43583 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DENRO43583 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DENRO43583 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DENRO43583 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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