Protein–RNA interactions for Protein: O00217

NDUFS8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS8O00217 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NDUFS8O00217 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NDUFS8O00217 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NDUFS8O00217 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NDUFS8O00217 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NDUFS8O00217 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NDUFS8O00217 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NDUFS8O00217 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NDUFS8O00217 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NDUFS8O00217 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NDUFS8O00217 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NDUFS8O00217 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NDUFS8O00217 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NDUFS8O00217 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NDUFS8O00217 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NDUFS8O00217 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NDUFS8O00217 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NDUFS8O00217 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NDUFS8O00217 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NDUFS8O00217 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NDUFS8O00217 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NDUFS8O00217 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NDUFS8O00217 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NDUFS8O00217 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NDUFS8O00217 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NDUFS8O00217 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NDUFS8O00217 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NDUFS8O00217 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NDUFS8O00217 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NDUFS8O00217 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NDUFS8O00217 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NDUFS8O00217 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NDUFS8O00217 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NDUFS8O00217 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NDUFS8O00217 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NDUFS8O00217 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NDUFS8O00217 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NDUFS8O00217 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NDUFS8O00217 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NDUFS8O00217 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NDUFS8O00217 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NDUFS8O00217 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NDUFS8O00217 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NDUFS8O00217 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NDUFS8O00217 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NDUFS8O00217 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NDUFS8O00217 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NDUFS8O00217 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NDUFS8O00217 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NDUFS8O00217 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NDUFS8O00217 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NDUFS8O00217 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NDUFS8O00217 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NDUFS8O00217 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NDUFS8O00217 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
NDUFS8O00217 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
NDUFS8O00217 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NDUFS8O00217 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NDUFS8O00217 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NDUFS8O00217 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NDUFS8O00217 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NDUFS8O00217 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NDUFS8O00217 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NDUFS8O00217 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NDUFS8O00217 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NDUFS8O00217 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NDUFS8O00217 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NDUFS8O00217 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NDUFS8O00217 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NDUFS8O00217 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NDUFS8O00217 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NDUFS8O00217 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NDUFS8O00217 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NDUFS8O00217 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NDUFS8O00217 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NDUFS8O00217 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NDUFS8O00217 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NDUFS8O00217 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NDUFS8O00217 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NDUFS8O00217 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NDUFS8O00217 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NDUFS8O00217 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NDUFS8O00217 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NDUFS8O00217 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NDUFS8O00217 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NDUFS8O00217 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NDUFS8O00217 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NDUFS8O00217 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NDUFS8O00217 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NDUFS8O00217 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NDUFS8O00217 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NDUFS8O00217 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NDUFS8O00217 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NDUFS8O00217 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NDUFS8O00217 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NDUFS8O00217 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NDUFS8O00217 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NDUFS8O00217 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NDUFS8O00217 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NDUFS8O00217 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms