Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 AC005753.1-201ENST00000623837 618 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC196-207ENST00000636229 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 TEX51-209ENST00000636457 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 AL356361.1-201ENST00000400943 1459 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 ZSCAN4-202ENST00000612521 1979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF3-205ENST00000413658 1441 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 AC125232.1-201ENST00000452554 1408 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 AL138688.2-201ENST00000623873 1513 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 CDY19P-201ENST00000411668 1613 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 CDY18P-201ENST00000438294 1609 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 GAPDHP72-203ENST00000638093 1602 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 RANGRF-201ENST00000226105 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL21-201ENST00000272274 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL21-204ENST00000326092 641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 RIPPLY2-201ENST00000369687 521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 CCNYL3-201ENST00000407030 998 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 VN1R3-201ENST00000418822 919 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 GNRHR-202ENST00000420975 859 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 AC074019.1-201ENST00000428788 1096 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC25A24P1-202ENST00000434803 1220 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 RPE-207ENST00000435437 858 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 THUMPD3-AS1-205ENST00000481221 683 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 AC116345.3-201ENST00000508255 449 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 CRYAB-203ENST00000525823 915 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00958-202ENST00000526388 607 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 FAU-206ENST00000529259 1125 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 RBM4B-207ENST00000531969 769 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 CRYAB-212ENST00000533280 545 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 OR7E15P-201ENST00000533484 967 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 ALG10-202ENST00000538927 571 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC02328-202ENST00000554647 522 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 AC090607.2-201ENST00000560331 695 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 AC137056.1-201ENST00000574654 341 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 AP001011.1-201ENST00000583546 690 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 FO704657.1-201ENST00000607013 400 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 FDPS-220ENST00000611010 1196 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 AL353626.1-201ENST00000613429 507 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 FGG-201ENST00000336098 1659 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 NPFFR2-204ENST00000395999 1866 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 Z99289.2-201ENST00000603682 1931 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 HSPD1P5-201ENST00000511127 1720 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 AC012668.3-202ENST00000417485 1642 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-12Q9BQ66 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms