Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD9

CASKIN1, Caskin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN1Q8WXD9 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASKIN1Q8WXD9 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASKIN1Q8WXD9 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASKIN1Q8WXD9 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASKIN1Q8WXD9 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms