Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms