Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms