Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Length 498 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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IRF5Q13568 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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IRF5Q13568 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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IRF5Q13568 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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IRF5Q13568 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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IRF5Q13568 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
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