Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms